El Departamento de Gestión Escolar es el encargado de llevar a cabo las gestiones del alumno ante la Unidad Académica como son:  trámites de inscripción, reinscripción, baja temporal, bajas definitivas, gestión de cambios de carrera, trámites de constancias y boletas.

Además, este Departamento es el encargado de salvaguardar los expedientes que contiene la trayectoria escolar de cada uno de los alumnos y alumnas, y se verifica que se cumpla con la normatividad vigente en el Instituto y los diversos acuerdos, tales como Convocatorias y Avisos con la cual se rige en el I.P.N. El Reglamento General de Estudios en conjunto con el Reglamento Interno siendo los principales reglamentos con los cuales el Departamento de Gestión Escolar se apega, en ellos se marca la normatividad de la trayectoria de los alumnos, además de la ley orgánica del Instituto y los demás reglamentos que la acompañan.